・はじめに 本記事では、三次元幾何学的形態測定法（Three-dimensional Geometric Morpho-metrics）について解説します。文章量削減のため、三次元幾何学的形態測定法：3DGM法と省略します。 3DGM法に関する解説記事の初回となる今回は、3DGM法の基礎的な部分について解説します。 本解説は、以前に解説した標本写真（二次元材料）を用いた幾何学的形態測定法の発展編となります。３Dモデルを用いた解析も、基本原理は二次元の場合と同じなので、まだ読了していない方は こちら を参考に基本原理を理解しておくと、スムーズに飲み込めると思います。 ・主流となりつつある3Dモデルを用いた形態学研究 研究の厳密性や再現性が求められる昨今、形態学においても研究に利用したデータの共有が必須となりつつあります。遺伝情報を用いた分子系統学や集団遺伝学などの分野では、研究に利用した遺伝情報データを"GenBank"という遺伝配列データベース上に公開することが強く推奨されています。遺伝情報を用いた研究が増加するほどGenBank上のデータベース

第4回目となる今回は，ソフトウェアMorphoJを用いて解析する方法について解説させていただきます． 実際に解析を進めていく上で，幾何学的形態測定法の基本原理の理解は必須なので，①～③を熟読した上で解析を進めることを推奨します． 2023.10.23 「３．よくあるトラブルシューティング集」を追記しました． 目次 １．MorphoJを扱う上での注意点 ２．MorphoJを用いた各解析と，各解析の簡単な説明 　 ①新規プロジェクトの作成とtpsファイルの読み込み 　 ②プロクラステス解析と補正座標の指定 　 ③主成分分析（Principal Component Analysis） 　 ④正準判別分析（Canonical Variate Analysis） 　 ⑤回帰分析（Regression Analysis） ３．よくあるトラブルシューティング集 １．MorphoJを扱う上での注意点 その1：MorphoJではセミランドマークを認識できない セミランドマークは2点の定義を持ったランドマーク（fixed landmark）間の等分点な

第3回目となる今回は，標本写真にランドマークを設定する方法について解説させていただきます． 複数のケースを想定し，この記事だけでトラブルシューティングできるように詳細まで解説したので，かなり長文になってしまっています．ご自身の解析に関係ない項目等は読み飛ばしていただけると幸...

梅雨明け宣言のないまま，晴れた夏の日が続いています． 昨晩も良く晴れ風もなかったので，上賀茂神社でホタルを撮影してきました． 19時半ごろの日没後すぐには飛び始めず，8時半を過ぎたあたりから乱舞し始めました． 超音波を使って夜の空で狩りをするコウモリは，飛翔性昆虫の蛾や蚊，...

第2回目となる今回は，幾何学的形態測定法に用いる標本写真を撮影する”コツ”について解説します． ・標本写真の必要条件 当該手法で用いる写真に最低限含めなければいけない要素は３つあります． １．研究する標本（これがないとはじまりません）...

・はじめに 今回から4回に分けて，幾何学的形態測定法（Geometric Morphometrics）について解説していきます． わたしが当該手法を学んだ修士学生の時に「この記事があればよかったな」というようなものを目指します．また，当該手法は現在でも発展が目まぐるしく，解...

この度，研究者としての個人ホームページを開設しました！ 当ホームページでは、私の研究成果や研究活動、プレスリリースや撮影した写真 など幅広く発信していく予定です． 随時更新してまいりますので，是非ご覧ください． 哲学の道の桜　2023年3月30日撮影